Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IP78347 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms