Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms