Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms