Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms