Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms