Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP9P55211 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms