Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ELLP55199 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ELLP55199 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELLP55199 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms