Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLTCL1P53675 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms