Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms