Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms