Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMTP48728 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMTP48728 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms