Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCLMP48507 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCLMP48507 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLMP48507 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCLMP48507 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCLMP48507 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCLMP48507 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms