Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RXRGP48443 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RXRGP48443 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RXRGP48443 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RXRGP48443 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RXRGP48443 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RXRGP48443 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RXRGP48443 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RXRGP48443 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RXRGP48443 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RXRGP48443 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RXRGP48443 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RXRGP48443 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RXRGP48443 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RXRGP48443 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RXRGP48443 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RXRGP48443 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RXRGP48443 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RXRGP48443 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RXRGP48443 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RXRGP48443 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RXRGP48443 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RXRGP48443 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RXRGP48443 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms