Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms