Protein–RNA interactions for Protein: P46969

RPE1, Ribulose-phosphate 3-epimerase, yeastyeast

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPE1P46969 RPL9BYNL067W 576 nt1.01□□□□□ -2.25
RPE1P46969 SCC2YDR180W 4482 nt1.01□□□□□ -2.25
RPE1P46969 ROM2YLR371W 4071 nt1□□□□□ -2.25
RPE1P46969 NOC3YLR002C 1992 nt1□□□□□ -2.25
RPE1P46969 SDH7YDR511W 402 nt1□□□□□ -2.25
RPE1P46969 YPR063CYPR063C 423 nt1□□□□□ -2.25
RPE1P46969 APL3YBL037W 3078 nt1□□□□□ -2.25
RPE1P46969 HCH1YNL281W 462 nt0.99□□□□□ -2.25
RPE1P46969 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.99□□□□□ -2.25
RPE1P46969 SAS3YBL052C 2496 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 SPT21YMR179W 2277 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 RPS24BYIL069C 408 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 YKL202WYKL202W 582 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 YLL020CYLL020C 306 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 YPL068CYPL068C 882 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 YPL205CYPL205C 345 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 MUK1YPL070W 1839 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 YPR117WYPR117W 7470 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 EAF1YDR359C 2949 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 STB6YKL072W 2301 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 SLY1YDR189W 2001 nt0.98□□□□□ -2.25
RPE1P46969 BEM2YER155C 6504 nt0.97□□□□□ -2.25
RPE1P46969 ALY2YJL084C 3141 nt0.97□□□□□ -2.25
RPE1P46969 EFR3YMR212C 2349 nt0.97□□□□□ -2.25
RPE1P46969 UPS1YLR193C 528 nt0.97□□□□□ -2.25
RPE1P46969 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.97□□□□□ -2.25
RPE1P46969 AIM9YER080W 1884 nt0.97□□□□□ -2.25
RPE1P46969 YAP6YDR259C 1152 nt0.96□□□□□ -2.26
RPE1P46969 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RPE1P46969 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RPE1P46969 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RPE1P46969 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RPE1P46969 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RPE1P46969 SDH2YLL041C 801 nt0.96□□□□□ -2.26
RPE1P46969 AIM44YPL158C 2277 nt0.95□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YAR009CYAR009C 3591 nt0.95□□□□□ -2.26
RPE1P46969 SCW11YGL028C 1629 nt0.94□□□□□ -2.26
RPE1P46969 MPT5YGL178W 2580 nt0.94□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YKL063CYKL063C 504 nt0.94□□□□□ -2.26
RPE1P46969 RPL26AYLR344W 384 nt0.94□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.94□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.94□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YPL229WYPL229W 621 nt0.94□□□□□ -2.26
RPE1P46969 ISF1YMR081C 1017 nt0.93□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YBR012CYBR012C 420 nt0.93□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YPL185WYPL185W 396 nt0.93□□□□□ -2.26
RPE1P46969 PRM3YPL192C 402 nt0.93□□□□□ -2.26
RPE1P46969 SET3YKR029C 2256 nt0.92□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YAR047CYAR047C 321 nt0.92□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YLR434CYLR434C 384 nt0.92□□□□□ -2.26
RPE1P46969 RRT1YBL048W 312 nt0.92□□□□□ -2.26
RPE1P46969 SLD3YGL113W 2007 nt0.92□□□□□ -2.26
RPE1P46969 NUP145YGL092W 3954 nt0.92□□□□□ -2.26
RPE1P46969 NPC2YDL046W 522 nt0.91□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YJL135WYJL135W 318 nt0.91□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YJR157WYJR157W 363 nt0.91□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YKL083WYKL083W 615 nt0.91□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.91□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YJR003CYJR003C 1560 nt0.91□□□□□ -2.26
RPE1P46969 ZIP2YGL249W 2115 nt0.91□□□□□ -2.26
RPE1P46969 SEC3YER008C 4011 nt0.9□□□□□ -2.26
RPE1P46969 YHL041WYHL041W 450 nt0.9□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YPL261CYPL261C 309 nt0.9□□□□□ -2.27
RPE1P46969 LCD1YDR499W 2244 nt0.9□□□□□ -2.27
RPE1P46969 CLU1YMR012W 3834 nt0.89□□□□□ -2.27
RPE1P46969 IFH1YLR223C 3258 nt0.89□□□□□ -2.27
RPE1P46969 PCF11YDR228C 1881 nt0.89□□□□□ -2.27
RPE1P46969 PAC1YOR269W 1485 nt0.89□□□□□ -2.27
RPE1P46969 snR72snR72 98 nt0.89□□□□□ -2.27
RPE1P46969 VPS20YMR077C 666 nt0.89□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YNL324WYNL324W 396 nt0.89□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YOL160WYOL160W 342 nt0.89□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YOR199WYOR199W 330 nt0.89□□□□□ -2.27
RPE1P46969 RPB10YOR210W 213 nt0.89□□□□□ -2.27
RPE1P46969 snR51snR51 107 nt0.89□□□□□ -2.27
RPE1P46969 SLI15YBR156C 2097 nt0.88□□□□□ -2.27
RPE1P46969 SMC1YFL008W 3678 nt0.88□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.88□□□□□ -2.27
RPE1P46969 NUP157YER105C 4176 nt0.88□□□□□ -2.27
RPE1P46969 STO1YMR125W 2586 nt0.87□□□□□ -2.27
RPE1P46969 COG4YPR105C 2586 nt0.87□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YER079WYER079W 633 nt0.87□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YOR029WYOR029W 336 nt0.87□□□□□ -2.27
RPE1P46969 ATG31YDR022C 591 nt0.86□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.86□□□□□ -2.27
RPE1P46969 FIG4YNL325C 2640 nt0.86□□□□□ -2.27
RPE1P46969 NIP100YPL174C 2607 nt0.86□□□□□ -2.27
RPE1P46969 PDE2YOR360C 1581 nt0.86□□□□□ -2.27
RPE1P46969 RAD34YDR314C 2079 nt0.85□□□□□ -2.27
RPE1P46969 MMS4YBR098W 2076 nt0.85□□□□□ -2.27
RPE1P46969 INP2YMR163C 2118 nt0.85□□□□□ -2.27
RPE1P46969 AGA2YGL032C 264 nt0.85□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.85□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.85□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YDL073WYDL073W 2955 nt0.84□□□□□ -2.27
RPE1P46969 PAM16YJL104W 450 nt0.84□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YNL058CYNL058C 951 nt0.84□□□□□ -2.27
RPE1P46969 RPS30BYOR182C 192 nt0.84□□□□□ -2.27
RPE1P46969 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.84□□□□□ -2.27
RPE1P46969 BUD3YCL014W 4911 nt0.84□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.1 ms