Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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