Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms