Protein–RNA interactions for Protein: P38737

ECM29, Proteasome component ECM29, yeastyeast

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Length 1,868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM29P38737 YPL044CYPL044C 549 nt-0.5□□□□□ -2.49
ECM29P38737 YHL042WYHL042W 453 nt-0.5□□□□□ -2.49
ECM29P38737 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
ECM29P38737 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
ECM29P38737 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
ECM29P38737 YPL197CYPL197C 414 nt-0.5□□□□□ -2.49
ECM29P38737 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt-0.51□□□□□ -2.49
ECM29P38737 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.51□□□□□ -2.49
ECM29P38737 EMC4YGL231C 573 nt-0.52□□□□□ -2.49
ECM29P38737 RSM18YER050C 417 nt-0.52□□□□□ -2.49
ECM29P38737 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt-0.52□□□□□ -2.49
ECM29P38737 YGL042CYGL042C 306 nt-0.53□□□□□ -2.49
ECM29P38737 CDC33YOL139C 642 nt-0.53□□□□□ -2.49
ECM29P38737 ERV15YBR210W 429 nt-0.53□□□□□ -2.49
ECM29P38737 YEL073CYEL073C 324 nt-0.54□□□□□ -2.5
ECM29P38737 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.54□□□□□ -2.5
ECM29P38737 BI4Q0120 1917 nt-0.54□□□□□ -2.5
ECM29P38737 ORC3YLL004W 1851 nt-0.54□□□□□ -2.5
ECM29P38737 YDL152WYDL152W 366 nt-0.54□□□□□ -2.5
ECM29P38737 snR128snR128 126 nt-0.54□□□□□ -2.5
ECM29P38737 RPL29YFR032C-A 180 nt-0.55□□□□□ -2.5
ECM29P38737 RFX1YLR176C 2436 nt-0.55□□□□□ -2.5
ECM29P38737 CMS1YLR003C 876 nt-0.56□□□□□ -2.5
ECM29P38737 SOV1YMR066W 2697 nt-0.56□□□□□ -2.5
ECM29P38737 NPC2YDL046W 522 nt-0.56□□□□□ -2.5
ECM29P38737 OLI1Q0130 231 nt-0.56□□□□□ -2.5
ECM29P38737 PFS1YHR185C 714 nt-0.56□□□□□ -2.5
ECM29P38737 MAM33YIL070C 801 nt-0.56□□□□□ -2.5
ECM29P38737 PET20YPL159C 762 nt-0.56□□□□□ -2.5
ECM29P38737 YPR099CYPR099C 357 nt-0.58□□□□□ -2.5
ECM29P38737 COX5BYIL111W 456 nt-0.59□□□□□ -2.5
ECM29P38737 RUF20RUF20 443 nt-0.59□□□□□ -2.5
ECM29P38737 YNL171CYNL171C 369 nt-0.59□□□□□ -2.5
ECM29P38737 ECM9YKR004C 1134 nt-0.6□□□□□ -2.51
ECM29P38737 YBR064WYBR064W 429 nt-0.6□□□□□ -2.51
ECM29P38737 snR24snR24 89 nt-0.6□□□□□ -2.51
ECM29P38737 VPS63YLR261C 327 nt-0.61□□□□□ -2.51
ECM29P38737 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.61□□□□□ -2.51
ECM29P38737 ATP20YPR020W 348 nt-0.61□□□□□ -2.51
ECM29P38737 MMS21YEL019C 804 nt-0.63□□□□□ -2.51
ECM29P38737 LSO2YGR169C-A 279 nt-0.63□□□□□ -2.51
ECM29P38737 RPM2YML091C 3609 nt-0.63□□□□□ -2.51
ECM29P38737 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.63□□□□□ -2.51
ECM29P38737 RUB1YDR139C 234 nt-0.63□□□□□ -2.51
ECM29P38737 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.63□□□□□ -2.51
ECM29P38737 TDA2YER071C 381 nt-0.63□□□□□ -2.51
ECM29P38737 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.63□□□□□ -2.51
ECM29P38737 DAD1YDR016C 285 nt-0.64□□□□□ -2.51
ECM29P38737 YLR271WYLR271W 825 nt-0.64□□□□□ -2.51
ECM29P38737 YPL185WYPL185W 396 nt-0.64□□□□□ -2.51
ECM29P38737 snR33snR33 183 nt-0.64□□□□□ -2.51
ECM29P38737 YOL118CYOL118C 309 nt-0.65□□□□□ -2.51
ECM29P38737 YKU70YMR284W 1809 nt-0.65□□□□□ -2.51
ECM29P38737 HTB1YDR224C 396 nt-0.65□□□□□ -2.51
ECM29P38737 snR79snR79 84 nt-0.66□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YDR008CYDR008C 351 nt-0.66□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YDR344CYDR344C 444 nt-0.66□□□□□ -2.52
ECM29P38737 RPS10BYMR230W 318 nt-0.66□□□□□ -2.52
ECM29P38737 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.66□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YJR079WYJR079W 330 nt-0.67□□□□□ -2.52
ECM29P38737 NIP1YMR309C 2439 nt-0.67□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.67□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.67□□□□□ -2.52
ECM29P38737 RPS26AYGL189C 360 nt-0.69□□□□□ -2.52
ECM29P38737 RPS7BYNL096C 573 nt-0.69□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.69□□□□□ -2.52
ECM29P38737 GSP1YLR293C 660 nt-0.69□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YGL204CYGL204C 306 nt-0.7□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.7□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.7□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.71□□□□□ -2.52
ECM29P38737 NFU1YKL040C 771 nt-0.71□□□□□ -2.52
ECM29P38737 TFB6YOR352W 1032 nt-0.71□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YPL205CYPL205C 345 nt-0.71□□□□□ -2.52
ECM29P38737 snR44snR44 211 nt-0.71□□□□□ -2.52
ECM29P38737 YJL120WYJL120W 324 nt-0.73□□□□□ -2.53
ECM29P38737 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.73□□□□□ -2.53
ECM29P38737 YNL146WYNL146W 303 nt-0.73□□□□□ -2.53
ECM29P38737 PAN3YKL025C 2040 nt-0.73□□□□□ -2.53
ECM29P38737 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.73□□□□□ -2.53
ECM29P38737 DFG10YIL049W 762 nt-0.73□□□□□ -2.53
ECM29P38737 OST4YDL232W 111 nt-0.74□□□□□ -2.53
ECM29P38737 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.74□□□□□ -2.53
ECM29P38737 IRC2YDR112W 309 nt-0.75□□□□□ -2.53
ECM29P38737 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.75□□□□□ -2.53
ECM29P38737 ASE1YOR058C 2658 nt-0.75□□□□□ -2.53
ECM29P38737 TIM13YGR181W 318 nt-0.75□□□□□ -2.53
ECM29P38737 LIN1YHR156C 1023 nt-0.75□□□□□ -2.53
ECM29P38737 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.75□□□□□ -2.53
ECM29P38737 MCM10YIL150C 1716 nt-0.76□□□□□ -2.53
ECM29P38737 YFR057WYFR057W 456 nt-0.77□□□□□ -2.53
ECM29P38737 YOL160WYOL160W 342 nt-0.77□□□□□ -2.53
ECM29P38737 GIM5YML094W 492 nt-0.78□□□□□ -2.53
ECM29P38737 UBS1YBR165W 834 nt-0.78□□□□□ -2.53
ECM29P38737 RSM23YGL129C 1353 nt-0.78□□□□□ -2.53
ECM29P38737 YJL135WYJL135W 318 nt-0.78□□□□□ -2.53
ECM29P38737 PTP2YOR208W 2253 nt-0.79□□□□□ -2.54
ECM29P38737 MRPL31YKL138C 396 nt-0.79□□□□□ -2.54
ECM29P38737 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.8□□□□□ -2.54
ECM29P38737 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.8□□□□□ -2.54
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