Protein–RNA interactions for Protein: P38302

NTC20, Pre-mRNA-splicing factor NTC20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTC20P38302 VPS54YDR027C 2670 nt1.39□□□□□ -2.19
NTC20P38302 INP2YMR163C 2118 nt1.39□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YAR053WYAR053W 297 nt1.38□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YOL160WYOL160W 342 nt1.38□□□□□ -2.19
NTC20P38302 snR14snR14 160 nt1.38□□□□□ -2.19
NTC20P38302 HKR1YDR420W 5409 nt1.38□□□□□ -2.19
NTC20P38302 SEC5YDR166C 2916 nt1.38□□□□□ -2.19
NTC20P38302 REV3YPL167C 4515 nt1.38□□□□□ -2.19
NTC20P38302 ZIP2YGL249W 2115 nt1.37□□□□□ -2.19
NTC20P38302 MSN5YDR335W 3675 nt1.37□□□□□ -2.19
NTC20P38302 CSN9YDR179C 489 nt1.37□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YJL135WYJL135W 318 nt1.37□□□□□ -2.19
NTC20P38302 SDH2YLL041C 801 nt1.37□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YBR174CYBR174C 315 nt1.37□□□□□ -2.19
NTC20P38302 HMRA1YCR097W 381 nt1.36□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.36□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.36□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.36□□□□□ -2.19
NTC20P38302 NIP100YPL174C 2607 nt1.36□□□□□ -2.19
NTC20P38302 KIP1YBL063W 3336 nt1.36□□□□□ -2.19
NTC20P38302 NUP188YML103C 4968 nt1.35□□□□□ -2.19
NTC20P38302 MAD1YGL086W 2250 nt1.35□□□□□ -2.19
NTC20P38302 ALY2YJL084C 3141 nt1.35□□□□□ -2.19
NTC20P38302 NPC2YDL046W 522 nt1.35□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.35□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.35□□□□□ -2.19
NTC20P38302 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.35□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.35□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YBR012CYBR012C 420 nt1.35□□□□□ -2.19
NTC20P38302 SCW11YGL028C 1629 nt1.35□□□□□ -2.19
NTC20P38302 RSM22YKL155C 1887 nt1.35□□□□□ -2.19
NTC20P38302 FYV8YGR196C 2454 nt1.34□□□□□ -2.19
NTC20P38302 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.34□□□□□ -2.19
NTC20P38302 RIM20YOR275C 1986 nt1.34□□□□□ -2.2
NTC20P38302 SWI4YER111C 3282 nt1.34□□□□□ -2.2
NTC20P38302 PET127YOR017W 2403 nt1.33□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YDL211CYDL211C 1119 nt1.33□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YLR255CYLR255C 354 nt1.33□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YOR029WYOR029W 336 nt1.33□□□□□ -2.2
NTC20P38302 AZF1YOR113W 2745 nt1.33□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YBP1YBR216C 2025 nt1.32□□□□□ -2.2
NTC20P38302 TRM3YDL112W 4311 nt1.32□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YDR426CYDR426C 378 nt1.32□□□□□ -2.2
NTC20P38302 COA6YMR244C-A 315 nt1.32□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YLL054CYLL054C 2532 nt1.32□□□□□ -2.2
NTC20P38302 RAD34YDR314C 2079 nt1.31□□□□□ -2.2
NTC20P38302 CDC39YCR093W 6327 nt1.31□□□□□ -2.2
NTC20P38302 SPT21YMR179W 2277 nt1.31□□□□□ -2.2
NTC20P38302 APL3YBL037W 3078 nt1.31□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.31□□□□□ -2.2
NTC20P38302 SPC98YNL126W 2541 nt1.31□□□□□ -2.2
NTC20P38302 RAD9YDR217C 3930 nt1.31□□□□□ -2.2
NTC20P38302 SLI15YBR156C 2097 nt1.3□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YIL102CYIL102C 306 nt1.3□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.3□□□□□ -2.2
NTC20P38302 BIL1YOR304C-A 231 nt1.3□□□□□ -2.2
NTC20P38302 CCH1YGR217W 6120 nt1.3□□□□□ -2.2
NTC20P38302 PIP2YOR363C 2991 nt1.29□□□□□ -2.2
NTC20P38302 MPT5YGL178W 2580 nt1.29□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.29□□□□□ -2.2
NTC20P38302 PCC1YKR095W-A 267 nt1.29□□□□□ -2.2
NTC20P38302 LCD1YDR499W 2244 nt1.29□□□□□ -2.2
NTC20P38302 BRR2YER172C 6492 nt1.29□□□□□ -2.2
NTC20P38302 COG4YPR105C 2586 nt1.29□□□□□ -2.2
NTC20P38302 snR56snR56 88 nt1.28□□□□□ -2.2
NTC20P38302 RPL35AYDL191W 363 nt1.28□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YLL020CYLL020C 306 nt1.28□□□□□ -2.2
NTC20P38302 RRT15YLR162W-A 189 nt1.28□□□□□ -2.2
NTC20P38302 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.27□□□□□ -2.21
NTC20P38302 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.27□□□□□ -2.21
NTC20P38302 CAT8YMR280C 4302 nt1.27□□□□□ -2.21
NTC20P38302 SLD3YGL113W 2007 nt1.27□□□□□ -2.21
NTC20P38302 GIM4YEL003W 336 nt1.26□□□□□ -2.21
NTC20P38302 MAM33YIL070C 801 nt1.26□□□□□ -2.21
NTC20P38302 YPR063CYPR063C 423 nt1.26□□□□□ -2.21
NTC20P38302 YLR422WYLR422W 5799 nt1.26□□□□□ -2.21
NTC20P38302 IFH1YLR223C 3258 nt1.26□□□□□ -2.21
NTC20P38302 SET3YKR029C 2256 nt1.26□□□□□ -2.21
NTC20P38302 EAF1YDR359C 2949 nt1.25□□□□□ -2.21
NTC20P38302 STB6YKL072W 2301 nt1.25□□□□□ -2.21
NTC20P38302 CDC36YDL165W 576 nt1.25□□□□□ -2.21
NTC20P38302 YJR011CYJR011C 786 nt1.25□□□□□ -2.21
NTC20P38302 YPR197CYPR197C 564 nt1.25□□□□□ -2.21
NTC20P38302 NUP192YJL039C 5052 nt1.24□□□□□ -2.21
NTC20P38302 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.24□□□□□ -2.21
NTC20P38302 YIR044CYIR044C 186 nt1.24□□□□□ -2.21
NTC20P38302 PFD1YJL179W 330 nt1.24□□□□□ -2.21
NTC20P38302 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.24□□□□□ -2.21
NTC20P38302 SEC3YER008C 4011 nt1.24□□□□□ -2.21
NTC20P38302 NUP145YGL092W 3954 nt1.23□□□□□ -2.21
NTC20P38302 HTB2YBL002W 396 nt1.23□□□□□ -2.21
NTC20P38302 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.23□□□□□ -2.21
NTC20P38302 MMS4YBR098W 2076 nt1.22□□□□□ -2.21
NTC20P38302 PBY1YBR094W 2262 nt1.22□□□□□ -2.21
NTC20P38302 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.22□□□□□ -2.21
NTC20P38302 PAN2YGL094C 3348 nt1.21□□□□□ -2.22
NTC20P38302 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.21□□□□□ -2.22
NTC20P38302 YAF9YNL107W 681 nt1.21□□□□□ -2.22
NTC20P38302 AIM44YPL158C 2277 nt1.2□□□□□ -2.22
NTC20P38302 FIG4YNL325C 2640 nt1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.9 ms