Protein–RNA interactions for Protein: P36169

SKG1, Suppressor of lethality of KEX2 GAS1 double null mutant protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKG1P36169 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SKG1P36169 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SKG1P36169 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SKG1P36169 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SKG1P36169 RRT1YBL048W 312 nt0.65□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YPR153WYPR153W 423 nt0.65□□□□□ -2.31
SKG1P36169 RIM20YOR275C 1986 nt0.65□□□□□ -2.31
SKG1P36169 MXR1YER042W 555 nt0.64□□□□□ -2.31
SKG1P36169 URM1YIL008W 300 nt0.64□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YKL123WYKL123W 381 nt0.64□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YDR269CYDR269C 324 nt0.63□□□□□ -2.31
SKG1P36169 STF2YGR008C 255 nt0.63□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YGR042WYGR042W 816 nt0.63□□□□□ -2.31
SKG1P36169 HUG1YML058W-A 207 nt0.63□□□□□ -2.31
SKG1P36169 MMS4YBR098W 2076 nt0.62□□□□□ -2.31
SKG1P36169 RPL9AYGL147C 576 nt0.62□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.62□□□□□ -2.31
SKG1P36169 NFU1YKL040C 771 nt0.62□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.62□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
SKG1P36169 NPC2YDL046W 522 nt0.61□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.61□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.61□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YOR029WYOR029W 336 nt0.61□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YJR003CYJR003C 1560 nt0.61□□□□□ -2.31
SKG1P36169 PAC1YOR269W 1485 nt0.61□□□□□ -2.31
SKG1P36169 SLI15YBR156C 2097 nt0.6□□□□□ -2.31
SKG1P36169 YCR001WYCR001W 315 nt0.6□□□□□ -2.31
SKG1P36169 TSC3YBR058C-A 243 nt0.6□□□□□ -2.31
SKG1P36169 PAN2YGL094C 3348 nt0.6□□□□□ -2.31
SKG1P36169 COG4YPR105C 2586 nt0.58□□□□□ -2.32
SKG1P36169 YHL042WYHL042W 453 nt0.58□□□□□ -2.32
SKG1P36169 BIG1YHR101C 1008 nt0.58□□□□□ -2.32
SKG1P36169 YLR269CYLR269C 351 nt0.58□□□□□ -2.32
SKG1P36169 LOA1YPR139C 903 nt0.58□□□□□ -2.32
SKG1P36169 WIP1YDR374W-A 270 nt0.57□□□□□ -2.32
SKG1P36169 ALG13YGL047W 609 nt0.57□□□□□ -2.32
SKG1P36169 INA22YIR024C 651 nt0.57□□□□□ -2.32
SKG1P36169 GPI15YNL038W 690 nt0.57□□□□□ -2.32
SKG1P36169 RPS30BYOR182C 192 nt0.57□□□□□ -2.32
SKG1P36169 WAR1YML076C 2835 nt0.56□□□□□ -2.32
SKG1P36169 OST1YJL002C 1431 nt0.56□□□□□ -2.32
SKG1P36169 LTE1YAL024C 4308 nt0.56□□□□□ -2.32
SKG1P36169 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.56□□□□□ -2.32
SKG1P36169 YJL135WYJL135W 318 nt0.56□□□□□ -2.32
SKG1P36169 YPL182CYPL182C 384 nt0.56□□□□□ -2.32
SKG1P36169 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.56□□□□□ -2.32
SKG1P36169 ZIP2YGL249W 2115 nt0.56□□□□□ -2.32
SKG1P36169 STE18YJR086W 333 nt0.55□□□□□ -2.32
SKG1P36169 BFR2YDR299W 1605 nt0.54□□□□□ -2.32
SKG1P36169 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.54□□□□□ -2.32
SKG1P36169 RPF1YHR088W 888 nt0.54□□□□□ -2.32
SKG1P36169 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.54□□□□□ -2.32
SKG1P36169 YML002WYML002W 2214 nt0.53□□□□□ -2.32
SKG1P36169 ISD11YER048W-A 285 nt0.53□□□□□ -2.32
SKG1P36169 PBI2YNL015W 228 nt0.53□□□□□ -2.32
SKG1P36169 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.53□□□□□ -2.32
SKG1P36169 EFR3YMR212C 2349 nt0.53□□□□□ -2.33
SKG1P36169 UBP3YER151C 2739 nt0.52□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YKL202WYKL202W 582 nt0.52□□□□□ -2.33
SKG1P36169 IES4YOR189W 351 nt0.52□□□□□ -2.33
SKG1P36169 UTP10YJL109C 5310 nt0.52□□□□□ -2.33
SKG1P36169 DBP6YNR038W 1890 nt0.52□□□□□ -2.33
SKG1P36169 TIM13YGR181W 318 nt0.51□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YSP1YHR155W 3687 nt0.51□□□□□ -2.33
SKG1P36169 EAF6YJR082C 342 nt0.51□□□□□ -2.33
SKG1P36169 RPS27AYKL156W 249 nt0.51□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YOL160WYOL160W 342 nt0.51□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YPL261CYPL261C 309 nt0.51□□□□□ -2.33
SKG1P36169 GPG1YGL121C 381 nt0.5□□□□□ -2.33
SKG1P36169 EMC4YGL231C 573 nt0.5□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.5□□□□□ -2.33
SKG1P36169 NOP9YJL010C 2001 nt0.5□□□□□ -2.33
SKG1P36169 PMP1YCR024C-A 123 nt0.49□□□□□ -2.33
SKG1P36169 snR72snR72 98 nt0.49□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.49□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YNR025CYNR025C 360 nt0.49□□□□□ -2.33
SKG1P36169 RAD34YDR314C 2079 nt0.49□□□□□ -2.33
SKG1P36169 GEA2YEL022W 4380 nt0.48□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YDL011CYDL011C 324 nt0.48□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YML108WYML108W 318 nt0.48□□□□□ -2.33
SKG1P36169 CDC33YOL139C 642 nt0.48□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.48□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.47□□□□□ -2.33
SKG1P36169 AIM29YKR074W 468 nt0.47□□□□□ -2.33
SKG1P36169 RPL38YLR325C 237 nt0.47□□□□□ -2.33
SKG1P36169 YBL071CYBL071C 309 nt0.47□□□□□ -2.33
SKG1P36169 CHS6YJL099W 2241 nt0.46□□□□□ -2.34
SKG1P36169 YCK3YER123W 1575 nt0.46□□□□□ -2.34
SKG1P36169 ECM12YHR021W-A 456 nt0.46□□□□□ -2.34
SKG1P36169 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.46□□□□□ -2.34
SKG1P36169 YHR125WYHR125W 306 nt0.46□□□□□ -2.34
SKG1P36169 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.46□□□□□ -2.34
SKG1P36169 YMR160WYMR160W 2451 nt0.46□□□□□ -2.34
SKG1P36169 ZEO1YOL109W 342 nt0.45□□□□□ -2.34
SKG1P36169 RPB10YOR210W 213 nt0.45□□□□□ -2.34
SKG1P36169 YOR282WYOR282W 321 nt0.45□□□□□ -2.34
SKG1P36169 PKH2YOL100W 3246 nt0.45□□□□□ -2.34
SKG1P36169 UBC7YMR022W 498 nt0.44□□□□□ -2.34
SKG1P36169 YBR064WYBR064W 429 nt0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms