Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJA4P35212 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJA4P35212 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA4P35212 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA4P35212 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA4P35212 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms