Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL9P32969 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL9P32969 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL9P32969 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL9P32969 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL9P32969 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL9P32969 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL9P32969 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL9P32969 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL9P32969 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL9P32969 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL9P32969 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL9P32969 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL9P32969 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL9P32969 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL9P32969 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL9P32969 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL9P32969 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL9P32969 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL9P32969 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms