Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC27P30260 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC27P30260 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC27P30260 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC27P30260 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC27P30260 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC27P30260 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC27P30260 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms