Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMPK1P30085 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms