Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID4AP29374 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms