Protein–RNA interactions for Protein: P28817

EHD3, 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial, yeastyeast

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Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EHD3P28817 PDE2YOR360C 1581 nt0.83□□□□□ -2.28
EHD3P28817 IFH1YLR223C 3258 nt0.83□□□□□ -2.28
EHD3P28817 ZIP2YGL249W 2115 nt0.82□□□□□ -2.28
EHD3P28817 CYC7YEL039C 342 nt0.82□□□□□ -2.28
EHD3P28817 TIM13YGR181W 318 nt0.82□□□□□ -2.28
EHD3P28817 HUG1YML058W-A 207 nt0.82□□□□□ -2.28
EHD3P28817 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.82□□□□□ -2.28
EHD3P28817 SET3YKR029C 2256 nt0.81□□□□□ -2.28
EHD3P28817 COG4YPR105C 2586 nt0.81□□□□□ -2.28
EHD3P28817 YER135CYER135C 393 nt0.81□□□□□ -2.28
EHD3P28817 STE18YJR086W 333 nt0.81□□□□□ -2.28
EHD3P28817 RRT1YBL048W 312 nt0.81□□□□□ -2.28
EHD3P28817 IRC23YOR044W 474 nt0.8□□□□□ -2.28
EHD3P28817 PAU24YBR301W 363 nt0.8□□□□□ -2.28
EHD3P28817 YDL158CYDL158C 309 nt0.79□□□□□ -2.28
EHD3P28817 YLR287CYLR287C 1068 nt0.79□□□□□ -2.28
EHD3P28817 WAR1YML076C 2835 nt0.79□□□□□ -2.28
EHD3P28817 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.78□□□□□ -2.28
EHD3P28817 ECL1YGR146C 636 nt0.78□□□□□ -2.28
EHD3P28817 PAM16YJL104W 450 nt0.78□□□□□ -2.28
EHD3P28817 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.78□□□□□ -2.28
EHD3P28817 YKL202WYKL202W 582 nt0.78□□□□□ -2.28
EHD3P28817 IES4YOR189W 351 nt0.78□□□□□ -2.28
EHD3P28817 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.77□□□□□ -2.29
EHD3P28817 CDC39YCR093W 6327 nt0.77□□□□□ -2.29
EHD3P28817 GPG1YGL121C 381 nt0.76□□□□□ -2.29
EHD3P28817 YBL071CYBL071C 309 nt0.76□□□□□ -2.29
EHD3P28817 YOR029WYOR029W 336 nt0.76□□□□□ -2.29
EHD3P28817 snR54snR54 86 nt0.76□□□□□ -2.29
EHD3P28817 ALG13YGL047W 609 nt0.75□□□□□ -2.29
EHD3P28817 AIM29YKR074W 468 nt0.75□□□□□ -2.29
EHD3P28817 YJR003CYJR003C 1560 nt0.74□□□□□ -2.29
EHD3P28817 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.74□□□□□ -2.29
EHD3P28817 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.74□□□□□ -2.29
EHD3P28817 YNL122CYNL122C 348 nt0.74□□□□□ -2.29
EHD3P28817 ZEO1YOL109W 342 nt0.74□□□□□ -2.29
EHD3P28817 CDC33YOL139C 642 nt0.74□□□□□ -2.29
EHD3P28817 ERP4YOR016C 624 nt0.74□□□□□ -2.29
EHD3P28817 YOR199WYOR199W 330 nt0.74□□□□□ -2.29
EHD3P28817 PKH2YOL100W 3246 nt0.74□□□□□ -2.29
EHD3P28817 ENV11YGR071C 2583 nt0.73□□□□□ -2.29
EHD3P28817 YGR290WYGR290W 444 nt0.73□□□□□ -2.29
EHD3P28817 NUP157YER105C 4176 nt0.73□□□□□ -2.29
EHD3P28817 GEA2YEL022W 4380 nt0.73□□□□□ -2.29
EHD3P28817 DIE2YGR227W 1578 nt0.72□□□□□ -2.29
EHD3P28817 NFU1YKL040C 771 nt0.72□□□□□ -2.29
EHD3P28817 ALY2YJL084C 3141 nt0.71□□□□□ -2.3
EHD3P28817 DBP6YNR038W 1890 nt0.71□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YDL011CYDL011C 324 nt0.71□□□□□ -2.3
EHD3P28817 BI2Q0110 1272 nt0.71□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YPL229WYPL229W 621 nt0.71□□□□□ -2.3
EHD3P28817 SLD3YGL113W 2007 nt0.71□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.7□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.7□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YLR171WYLR171W 390 nt0.7□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.7□□□□□ -2.3
EHD3P28817 RPS30BYOR182C 192 nt0.7□□□□□ -2.3
EHD3P28817 CUL3YGR003W 2235 nt0.7□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YJL135WYJL135W 318 nt0.69□□□□□ -2.3
EHD3P28817 PAC1YOR269W 1485 nt0.68□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YKL083WYKL083W 615 nt0.68□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YNL058CYNL058C 951 nt0.68□□□□□ -2.3
EHD3P28817 snR189snR189 189 nt0.68□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YPR153WYPR153W 423 nt0.68□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.68□□□□□ -2.3
EHD3P28817 NHP2YDL208W 471 nt0.67□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YDR521WYDR521W 336 nt0.67□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.67□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YAR047CYAR047C 321 nt0.67□□□□□ -2.3
EHD3P28817 CMC4YMR194C-B 222 nt0.67□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YOL160WYOL160W 342 nt0.67□□□□□ -2.3
EHD3P28817 snR51snR51 107 nt0.67□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YDL196WYDL196W 330 nt0.66□□□□□ -2.3
EHD3P28817 ISD11YER048W-A 285 nt0.66□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.66□□□□□ -2.3
EHD3P28817 INA22YIR024C 651 nt0.66□□□□□ -2.3
EHD3P28817 YIR044CYIR044C 186 nt0.66□□□□□ -2.3
EHD3P28817 snR41snR41 95 nt0.66□□□□□ -2.3
EHD3P28817 snR72snR72 98 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 YOR282WYOR282W 321 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 YPL261CYPL261C 309 nt0.65□□□□□ -2.31
EHD3P28817 FYV7YLR068W 456 nt0.64□□□□□ -2.31
EHD3P28817 OST1YJL002C 1431 nt0.64□□□□□ -2.31
EHD3P28817 YLL007CYLL007C 1998 nt0.63□□□□□ -2.31
EHD3P28817 UTP20YBL004W 7482 nt0.63□□□□□ -2.31
EHD3P28817 SDH7YDR511W 402 nt0.63□□□□□ -2.31
EHD3P28817 YNL303WYNL303W 348 nt0.63□□□□□ -2.31
EHD3P28817 PAN2YGL094C 3348 nt0.63□□□□□ -2.31
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