Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBRP28336 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBRP28336 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBRP28336 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBRP28336 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBRP28336 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBRP28336 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBRP28336 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBRP28336 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBRP28336 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBRP28336 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBRP28336 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBRP28336 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms