Protein–RNA interactions for Protein: P25386

USO1, Intracellular protein transport protein USO1, yeast

Predictions only

Length 1,790 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
USO1	P25386	RPL42B	YHR141C	321 nt		-1.57	□□□□□ -2.66
USO1	P25386	RPL42A	YNL162W	321 nt		-1.57	□□□□□ -2.66
USO1	P25386	RTC6	YPL183W-A	282 nt		-1.57	□□□□□ -2.66
USO1	P25386	OST4	YDL232W	111 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
USO1	P25386	IST3	YIR005W	447 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
USO1	P25386	CDC33	YOL139C	642 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
USO1	P25386	YAL067W-A	YAL067W-A	228 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
USO1	P25386	RPS25B	YLR333C	327 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
USO1	P25386	YPR172W	YPR172W	603 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
USO1	P25386	YDL009C	YDL009C	324 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
USO1	P25386	YLR402W	YLR402W	192 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
USO1	P25386	YGR115C	YGR115C	780 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
USO1	P25386	YOR345C	YOR345C	351 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
USO1	P25386	YDR344C	YDR344C	444 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
USO1	P25386	VAB2	YEL005C	849 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
USO1	P25386	GIM5	YML094W	492 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
USO1	P25386	IPP1	YBR011C	864 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
USO1	P25386	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		-1.65	□□□□□ -2.67
USO1	P25386	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		-1.65	□□□□□ -2.67
USO1	P25386	ATX1	YNL259C	222 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	YOR015W	YOR015W	360 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	YDR182W-A	YDR182W-A	204 nt		-1.69	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	YLR282C	YLR282C	342 nt		-1.69	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	YPL185W	YPL185W	396 nt		-1.69	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	YBR121C-A	YBR121C-A	159 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	BI3	Q0115	1554 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	YKL111C	YKL111C	336 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	MMS21	YEL019C	804 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	AEP1	YMR064W	1557 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
USO1	P25386	PHO80	YOL001W	882 nt		-1.72	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	snR44	snR44	211 nt		-1.74	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	YLR399W-A	YLR399W-A	105 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	YBR184W	YBR184W	1572 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	ATC1	YDR184C	885 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	BET4	YJL031C	984 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	YHR028W-A	YHR028W-A	321 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	SEM1	YDR363W-A	270 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	RTR2	YDR066C	591 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	YOR248W	YOR248W	303 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	BLS1	YLR408C	369 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	YOL118C	YOL118C	309 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
USO1	P25386	YDR194W-A	YDR194W-A	153 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
USO1	P25386	YML007C-A	YML007C-A	111 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
USO1	P25386	AI4	Q0065	1671 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
USO1	P25386	EST1	YLR233C	2100 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
USO1	P25386	YJR079W	YJR079W	330 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
USO1	P25386	SUS1	YBR111W-A	291 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
USO1	P25386	YIM2	YMR151W	438 nt		-1.82	□□□□□ -2.7
USO1	P25386	YBR064W	YBR064W	429 nt		-1.82	□□□□□ -2.7
USO1	P25386	YER046W-A	YER046W-A	330 nt		-1.84	□□□□□ -2.7
USO1	P25386	YFR057W	YFR057W	456 nt		-1.84	□□□□□ -2.7
USO1	P25386	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		-1.84	□□□□□ -2.7
USO1	P25386	RFA3	YJL173C	369 nt		-1.85	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	YHR138C	YHR138C	345 nt		-1.87	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	YNL319W	YNL319W	441 nt		-1.87	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	NUP82	YJL061W	2142 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	IRC2	YDR112W	309 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	TDA2	YER071C	381 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	YLR287C	YLR287C	1068 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	YGL006W-A	YGL006W-A	111 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	ECL1	YGR146C	636 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	PFS1	YHR185C	714 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	YML047W-A	YML047W-A	366 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	ARV1	YLR242C	966 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
USO1	P25386	YHR054C	YHR054C	1065 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	YKE2	YLR200W	345 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	YKL065W-A	YKL065W-A	222 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	CMC1	YKL137W	336 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	ATP15	YPL271W	189 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	YFL063W	YFL063W	456 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	YGL123C-A	YGL123C-A	231 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	TAR1	YLR154W-C	375 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	YGL258W-A	YGL258W-A	234 nt		-1.94	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	YJL114W	YJL114W	681 nt		-1.95	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		-1.95	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	UBS1	YBR165W	834 nt		-1.95	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	BI4	Q0120	1917 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	POL32	YJR043C	1053 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
USO1	P25386	MFA2	YNL145W	117 nt		-1.98	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	SPO21	YOL091W	1830 nt		-1.99	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	RUB1	YDR139C	234 nt		-1.99	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	YIL066W-A	YIL066W-A	444 nt		-1.99	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	YAL069W	YAL069W	315 nt		-1.99	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	YDL152W	YDL152W	366 nt		-2	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	PAA1	YDR071C	576 nt		-2	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	COX8	YLR395C	237 nt		-2	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	FAR3	YMR052W	615 nt		-2	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	YPR074W-A	YPR074W-A	171 nt		-2	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	YLL032C	YLL032C	2478 nt		-2	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	YER079W	YER079W	633 nt		-2	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	YDL068W	YDL068W	330 nt		-2.01	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	YBR051W	YBR051W	351 nt		-2.02	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	APQ13	YJL075C	417 nt		-2.03	□□□□□ -2.73
USO1	P25386	YLR271W	YLR271W	825 nt		-2.03	□□□□□ -2.73

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