Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA5P22460 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA5P22460 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms