Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL17P18621 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL17P18621 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPL17P18621 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL17P18621 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL17P18621 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms