Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms