Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB3P16520 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GNB3P16520 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GNB3P16520 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB3P16520 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB3P16520 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms