Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms