Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms