Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-EP13747 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-EP13747 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-EP13747 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-EP13747 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-EP13747 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms