Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DMDP11532 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DMDP11532 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DMDP11532 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DMDP11532 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DMDP11532 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DMDP11532 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DMDP11532 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DMDP11532 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DMDP11532 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms