Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP1P11387 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1P11387 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1P11387 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1P11387 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1P11387 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms