Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD4P09016 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms