Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHOP08100 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHOP08100 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHOP08100 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHOP08100 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHOP08100 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHOP08100 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RHOP08100 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHOP08100 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHOP08100 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOP08100 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOP08100 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOP08100 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOP08100 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOP08100 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOP08100 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOP08100 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOP08100 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOP08100 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOP08100 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOP08100 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOP08100 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOP08100 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOP08100 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOP08100 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOP08100 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOP08100 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOP08100 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms