Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD2O96028 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD2O96028 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD2O96028 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD2O96028 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD2O96028 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD2O96028 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD2O96028 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD2O96028 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD2O96028 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD2O96028 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD2O96028 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD2O96028 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD2O96028 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD2O96028 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD2O96028 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD2O96028 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD2O96028 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD2O96028 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD2O96028 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD2O96028 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD2O96028 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD2O96028 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD2O96028 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD2O96028 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD2O96028 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD2O96028 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD2O96028 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD2O96028 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD2O96028 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NSD2O96028 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NSD2O96028 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NSD2O96028 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NSD2O96028 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NSD2O96028 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSD2O96028 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSD2O96028 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSD2O96028 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSD2O96028 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSD2O96028 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSD2O96028 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSD2O96028 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSD2O96028 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSD2O96028 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSD2O96028 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSD2O96028 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSD2O96028 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSD2O96028 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSD2O96028 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSD2O96028 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSD2O96028 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NSD2O96028 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NSD2O96028 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NSD2O96028 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSD2O96028 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSD2O96028 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSD2O96028 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSD2O96028 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSD2O96028 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms