Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms