Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LY75O60449 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LY75O60449 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LY75O60449 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LY75O60449 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY75O60449 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY75O60449 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY75O60449 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LY75O60449 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY75O60449 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LY75O60449 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY75O60449 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY75O60449 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY75O60449 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY75O60449 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY75O60449 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY75O60449 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY75O60449 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY75O60449 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY75O60449 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY75O60449 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY75O60449 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY75O60449 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LY75O60449 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LY75O60449 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY75O60449 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LY75O60449 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LY75O60449 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LY75O60449 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LY75O60449 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms