Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO3O43524 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.58■■■□□ 2
FOXO3O43524 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXO3O43524 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXO3O43524 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXO3O43524 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXO3O43524 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXO3O43524 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXO3O43524 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms