Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms