Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM6AO15550 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM6AO15550 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms