Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms