Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms