Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms