Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AMYH02020865.1-201ENST00000621140 2591 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 C1orf87-201ENST00000371201 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 FABP1-201ENST00000295834 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RPL7P13-201ENST00000415103 741 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL160153.1-201ENST00000415285 429 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC239367.1-201ENST00000439389 936 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR2AI1P-201ENST00000448534 932 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC013264.1-201ENST00000449346 455 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PPIAP28-201ENST00000458378 485 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RN7SL63P-201ENST00000468228 304 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RN7SL107P-201ENST00000478127 283 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GAPDHP22-201ENST00000491037 413 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC244505.1-201ENST00000502642 307 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC022796.1-202ENST00000531882 477 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 NOVA1-AS1-201ENST00000547786 818 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC138907.5-201ENST00000561744 273 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL034376.2-201ENST00000568110 573 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC005828.5-201ENST00000582741 355 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC012301.1-201ENST00000586391 581 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 IGKV3OR2-5-201ENST00000605851 281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC073218.2-201ENST00000606468 295 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL590705.1-201ENST00000607322 484 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL136304.1-201ENST00000607790 509 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL139220.2-217ENST00000609027 940 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL592227.1-201ENST00000614748 126 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MIR6505-201ENST00000617206 71 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZNHIT3-204ENST00000617429 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC02086-204ENST00000628006 786 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC079602.4-201ENST00000637836 532 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC073072.1-201ENST00000325042 1364 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC100771.2-201ENST00000525833 1350 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TRHR-202ENST00000518632 1660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PIGK-201ENST00000359130 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MIR548XHG-201ENST00000355189 673 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GIP-201ENST00000357424 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RNA5SP336-201ENST00000364189 117 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL136968.2-201ENST00000407959 354 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SNORA73.3-201ENST00000410213 189 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms