Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL445193.2-201ENST00000419596 620 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL023584.1-201ENST00000437067 349 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 HSPA8P3-201ENST00000449300 780 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RPL5P17-201ENST00000469685 877 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RN7SL65P-201ENST00000485221 315 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC098583.2-201ENST00000504151 372 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 OR7E129P-201ENST00000504655 968 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 LINC02058-201ENST00000507491 707 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC021242.2-202ENST00000522129 545 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RN7SL840P-201ENST00000606883 284 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 GSTTP1-204ENST00000621179 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CWC27-204ENST00000508024 2103 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ZC3H14-203ENST00000318308 1384 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 LINC01747-203ENST00000634603 1377 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RHOJ-201ENST00000316754 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC073324.1-201ENST00000425993 1435 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 SCHLAP1-201ENST00000629145 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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PDK4Q16654 AC002463.1-201ENST00000453459 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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PDK4Q16654 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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PDK4Q16654 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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PDK4Q16654 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CCDC63-204ENST00000552694 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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PDK4Q16654 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ALDOB-201ENST00000374855 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 HSD11B1-202ENST00000367027 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TATDN2P1-201ENST00000443767 2331 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC007923.2-201ENST00000584218 1591 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CXCR2P1-201ENST00000439871 2503 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 PPIAP2-201ENST00000414143 492 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC073346.1-202ENST00000430610 544 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC114928.1-201ENST00000446516 415 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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